Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms