Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL22A1Q8NFW1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL22A1Q8NFW1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL22A1Q8NFW1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL22A1Q8NFW1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL22A1Q8NFW1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL22A1Q8NFW1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL22A1Q8NFW1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL22A1Q8NFW1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL22A1Q8NFW1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL22A1Q8NFW1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL22A1Q8NFW1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL22A1Q8NFW1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL22A1Q8NFW1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL22A1Q8NFW1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL22A1Q8NFW1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL22A1Q8NFW1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL22A1Q8NFW1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL22A1Q8NFW1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL22A1Q8NFW1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL22A1Q8NFW1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms