Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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