Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM7

SUPT20H, Transcription factor SPT20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT20HQ8NEM7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUPT20HQ8NEM7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms