Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms