Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZIC4Q8N9L1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms