Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms