Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms