Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q71RC1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q71RC1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q71RC1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms