Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP50Q70EL3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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