Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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USP53Q70EK8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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USP53Q70EK8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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USP53Q70EK8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP53Q70EK8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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