Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXIP1Q6ZW49 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms