Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms