Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms