Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3HQ6NTF7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms