Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL2Q6F5E8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms