Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms