Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms