Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC181Q5TID7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC181Q5TID7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC181Q5TID7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC181Q5TID7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC181Q5TID7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC181Q5TID7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC181Q5TID7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC181Q5TID7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC181Q5TID7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC181Q5TID7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC181Q5TID7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC181Q5TID7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC181Q5TID7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC181Q5TID7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC181Q5TID7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC181Q5TID7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms