Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SAMD9Q5K651 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SAMD9Q5K651 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms