Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms