Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SBK1Q52WX2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms