Protein–RNA interactions for Protein: Q30154

HLA-DRB5, HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 5 chain, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRB5Q30154 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DRB5Q30154 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms