Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR2Q2VWA4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms