Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTF1Q16619 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms