Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
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