Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNGA3Q16281 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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