Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
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