Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms