Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3GAP1Q15042 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
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