Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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COL4A6Q14031 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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COL4A6Q14031 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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COL4A6Q14031 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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COL4A6Q14031 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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