Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK13Q14004 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
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