Protein–RNA interactions for Protein: Q13976

PRKG1, cGMP-dependent protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKG1Q13976 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKG1Q13976 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKG1Q13976 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms