Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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