Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
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