Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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