Protein–RNA interactions for Protein: Q13395

TARBP1, Probable methyltransferase TARBP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1Q13395 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TARBP1Q13395 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms