Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATMQ13315 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATMQ13315 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATMQ13315 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATMQ13315 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATMQ13315 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATMQ13315 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATMQ13315 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATMQ13315 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATMQ13315 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATMQ13315 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATMQ13315 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATMQ13315 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATMQ13315 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATMQ13315 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATMQ13315 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATMQ13315 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATMQ13315 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATMQ13315 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATMQ13315 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATMQ13315 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATMQ13315 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATMQ13315 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATMQ13315 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATMQ13315 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATMQ13315 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATMQ13315 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATMQ13315 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATMQ13315 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATMQ13315 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATMQ13315 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATMQ13315 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATMQ13315 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATMQ13315 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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