Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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