Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLFQ13129 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RLFQ13129 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLFQ13129 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLFQ13129 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLFQ13129 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RLFQ13129 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLFQ13129 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLFQ13129 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RLFQ13129 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RLFQ13129 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLFQ13129 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RLFQ13129 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLFQ13129 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLFQ13129 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLFQ13129 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLFQ13129 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLFQ13129 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLFQ13129 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLFQ13129 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLFQ13129 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLFQ13129 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLFQ13129 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLFQ13129 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLFQ13129 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLFQ13129 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLFQ13129 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLFQ13129 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLFQ13129 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLFQ13129 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLFQ13129 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLFQ13129 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RLFQ13129 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLFQ13129 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLFQ13129 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLFQ13129 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLFQ13129 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLFQ13129 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLFQ13129 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLFQ13129 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLFQ13129 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RLFQ13129 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLFQ13129 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLFQ13129 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLFQ13129 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLFQ13129 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLFQ13129 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLFQ13129 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLFQ13129 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RLFQ13129 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RLFQ13129 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RLFQ13129 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RLFQ13129 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RLFQ13129 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RLFQ13129 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RLFQ13129 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RLFQ13129 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLFQ13129 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLFQ13129 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RLFQ13129 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLFQ13129 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLFQ13129 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLFQ13129 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLFQ13129 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLFQ13129 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLFQ13129 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLFQ13129 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLFQ13129 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLFQ13129 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLFQ13129 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLFQ13129 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLFQ13129 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLFQ13129 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLFQ13129 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLFQ13129 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLFQ13129 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLFQ13129 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLFQ13129 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLFQ13129 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLFQ13129 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLFQ13129 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLFQ13129 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLFQ13129 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RLFQ13129 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLFQ13129 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLFQ13129 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RLFQ13129 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLFQ13129 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLFQ13129 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLFQ13129 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLFQ13129 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLFQ13129 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLFQ13129 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLFQ13129 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RLFQ13129 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLFQ13129 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLFQ13129 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLFQ13129 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RLFQ13129 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLFQ13129 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms