Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms