Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PRDM2Q13029 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
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