Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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PTP4A2Q12974 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
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PTP4A2Q12974 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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PTP4A2Q12974 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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PTP4A2Q12974 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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PTP4A2Q12974 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
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PTP4A2Q12974 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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PTP4A2Q12974 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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PTP4A2Q12974 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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PTP4A2Q12974 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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PTP4A2Q12974 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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