Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms