Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
GRIN2AQ12879 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
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