Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TWF1Q12792 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms