Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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GTF3C1Q12789 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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GTF3C1Q12789 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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GTF3C1Q12789 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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GTF3C1Q12789 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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GTF3C1Q12789 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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GTF3C1Q12789 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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