Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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