Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms