Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAMSAP2Q08AD1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms